8月30日報道 綜合香港媒體報道，菲律賓總統阿基諾三世下令，政府跨部門小組“事故檢討委員會”(IRC)須于三個星期內提交人質事件調查報告。

港警調查一度受阻

原建議的5名小組成員之中，除保留司法部長和內政部長外，阿基諾拒絕讓國家警察總長貝爾索薩、國家調查局(NBI)局長和國警內部審計部主管擔任小組成員，改由3名來自私人組織的代表取代，包括當地知名“反罪惡斗士”洪玉華。

當地反貪污自愿組織VACC認為，應由獨立機構調查，并邀請香港警方代表加入，以防有人企圖掩飾真相。

香港特區署理警務處長曾偉雄表示，7名香港警務人員已在菲律賓馬尼拉參與調查工作，包括已登上肇事旅游巴士搜證、約見相關證人以及作彈道檢證等。

不過，菲律賓傳媒報道，當地警方禁止香港法證人員登上旅游巴士調查，只容許他們在外觀察。菲媒ABS-CBN引述領導調查工作的菲律賓警長的話指，要待菲當局完成調查，才可讓香港警方調查，又指他們必須得到菲司法部和警方批準，才可登上旅游巴士。

港府保安局強調，香港警方已經獲得菲律賓警方書面授權，保證提供協助，而中國大使館正在協助，以取得菲政府合作。

港府保安局副局長黎棟國29日在電臺節目中說，希望在調查期間，資料搜集得越詳盡越好，透過與菲當局交換及分享數據，令調查報告更完整。黎棟國又說，到馬尼拉協助受害人家屬期間，覺得菲律賓官員相當重視他們提出的要求。

黎棟國表示說，香港警方已完成8名死者的驗尸工作，特別是其中3具尸體沒在菲國檢驗，即使已解剖的5具尸體，仍可察看子彈進入身體時造成的創傷有多大，身上的彈頭、碎片也可詳細檢驗，而警方稍后也會向幸存的旅游團成員錄取口供。

菲警對初步調查結果改口

另外，港媒引述菲律賓媒體ABS-CBN報道指，菲警方改口稱在旅游巴上發現的50個彈殼雖然全部由M16步槍發射，但未肯定是否全部由槍手門多薩的步槍發射，也不肯定8名遇難港人是否全被門多薩射殺。

8月27日，菲律賓警方公布了對事件的初步調查結果，否認誤殺人質傳言，稱8名港人均遭劫持者槍殺。